Inför tisdagens möte i Prag hade Sparta bara förlorat två av sina 13 senaste matcher i det europeiska cupspelet, samtidigt som Atlético Madrid bara vunnit två av sina senaste elva bortamatcher i Champions League.
Men i mötet i Prag hade Sparta inte en chans, och Milan – med Zlatan Ibrahimovic på läktaren – vann med tennissiffror efter att ha haft 2–0 i halvtid.
Julian Alvarez och Angel Correa gjorde två mål vardera, den sistnämnde sina mål med fyra minuters mellanrum i slutet av matchen.
Sparta Prag har nu förlorat tre matcher i följd och är i den nedre delen av tabellen med fyra poäng. Atlético har nio poäng.
Slovan Bratislava reducerade till 2–3 mot Milan i den 88:e minuten, men ett rött kort på Marko Tolic några minuter senare försvårade chansen till kvittering. Tolic varnades för en kapning och fick därefter ytterligare ett gult kort när han konfronterade domaren.
Slovan är fortfarande utan poäng medan Milan nu har nio.