Olyckan skedde mellan stationerna Sant Sadurní d’Anoia och Gelida i Barcelona i Katalonien, rapporterar lokala medier.
Lokföraren har omkommit i olyckan, uppger polisen för spanska RTVE. 37 personer ska även ha skadats, varav fem allvarligt.
20 ambulanser och 38 brandkårsenheter har skickats till platsen, enligt räddningstjänsten.
En tidig hypotes är att en stödmur bredvid järnvägen kan ha rasat till följd av kraftigt regn de senaste dagarna, enligt uppgifter till El País. Något som ska ha lett till att pendeltåget spårade ur när det kolliderade med den raserade muren.
Tågtrafiken i Katalonien är inställd efter olyckan.
De första larmen om olyckan kom klockan 21.02 på tisdagskvällen.
I en separat incident spårade ett annat tåg som också ingår i Barcelonas pendeltågsnät ur, men inga skador rapporterades. Det trafikerade mellan Blanes och Maçanet. Olyckan orsakades av stenar som föll ner på spåren till följd av ovädret som drabbade Girona på tisdagen, skriver El País.
Olyckan sker bara två dagar efter den allvarliga tågolyckan i Amaduz där två höghastighetståg spårade ur på söndagen. Minst 42 personer dog, och över 120 personer skadades.
Läs mer:
Vittnesmålen om svåra tågolyckan: ”Min kropp var någon annanstans”
Tre dagars landssorg i Spanien efter tågolyckan
