Tiotals människor rapporteras ha skadats i attackerna. De flesta av offren uppges vara kvinnor och barn. Skolorna Hassan Salameh och Al-Nasr användes som flyktingläger för palestinier som tvingats lämna sina hem på grund av kriget.
Israels militär bekräftar attackerna och säger att man attackerat kommandocentraler tillhörande terrorstämplade Hamas.
Sedan den 6 juli har minst elva skolor i Gaza attackerats av israeliska styrkor.
Tidigare uppgav Gazas hälsomyndigheter, som kontrolleras av Hamas, att israeliska attacker dödat minst 18 människor i Gaza tidigt under söndagen.
En av attackerna utfördes mot ett tältläger utanför al-Aqsa-sjukhuset i staden Deir al-Balah i centrala Gaza, med fyra döda som följd.
En AP-journalist bevittnade hur människor sprang till platsen för att släcka en brand efter attacken och hjälpa skadade. Tusentals fördrivna Gazabor har sökt skydd vid sjukhuset.
I en annan israelisk attack mot ett hus i Deir al-Balah dödades en flicka och hennes föräldrar, uppger al-Aqsa-sjukhuset.
En familj på åtta personer; föräldrar, tre barn samt en morförälder, utplånades när ett hus i norra Gaza träffades. Ytterligare tre personer dödades i ett fordon i Gaza stad, enligt räddningsarbetare.
