Enligt videoklipp som BBC tagit del av ska en grupp personer ha förolämpat utländska besökare och krävt att de lämnar området. Även receptionen uppges ha vandaliserats.
Museet, som ligger i Benin City i södra Nigeria och har kostat flera miljoner dollar att bygga, var delvis tänkt som en plats för de återlämnade Beninbronserna – konstskatter som stals av brittiska soldater under 1800-talets plundringar.
Men en utdragen konflikt om vem som ska förvalta de ovärderliga föremålen har gjort att de ännu inte placerats på museet, något som väckt ilska bland demonstranterna.
Enligt ett uttalande från museet fördes samtliga gäster i säkerhet. Mowaa bad samtidigt om ursäkt för det inträffade och uppgav att protesten tycks ha sitt ursprung i motsättningar mellan den nuvarande och den tidigare delstatsledningen.
Läs mer:
Världskulturmuseerna får återlämna bronser till Nigeria
Afrikansk segervittring i striden om det koloniala stöldgodset
