Upptrappningen började med ett uttalande den 7 november, då Sanae Takaichi svarade på en hypotetisk fråga om Taiwan, en självstyrande demokrati, som Kina anser är en del av dess territorium och därför är ett ämne som utomstående inte ska lägga sig i.
Den japanska premiärministern sade inför landets parlament att en kinesisk blockad till havs eller andra åtgärder mot Taiwan skulle kunna utlösa ett militärt svar från Japan.
Takaichi har tidigare varnat för Kina som ett växande hot i regionen.
Hennes svar skilde sig nu från vad hennes företrädare sagt i frågan, så till vida att de alla visserligen uttryckt oro för Kinas hot mot Taiwan, men inte öppet sagt hur Japan skulle reagera.
Hon har senare vägrat att ta tillbaka uttalandet, men har för samma parlamentariska grupp förklarat att hon i fortsättningen ska undvika att tala om liknande scenarier.
Japans utrikesminister Toshimitsu Motegi har försäkrat att Japans ståndpunkt om Taiwan inte ändrats. Det har inte lugnat myndigheter och statskontrollerade medier i Peking, som fortsatt publicera kritiska uttalanden och artiklar.
Kina har svarat med att varna invånare från att resa till Japan med hänvisning till säkerhetsläget, utan att detaljer lagts fram om vad faran skulle bestå i. Sju miljoner kineser besökte Japan förra året – de har kraftigt bidragit till boomen för turistindustrin i Japan.
Liknande kinesiska varningar har tidigare utgått när Kina hamnat i konflikt med andra länder, till exempel Sydkorea – vilket då påverkat turistindustrin.
Kinas utbildningsdepartement har även uppmanat kinesiska studenter i Japan att följa säkerhetsläget noggrant. Över 100 000 kinesiska invånare var i fjol inskrivna vid japanska universitet och lärosäten.
Japan skickade på måndagen ett sändebud till Peking för att lugna situationen. Uppgiften består, enligt japanska medier, i att förklara för den kinesiska sidan att Japan, trots premiärministerns uttalande, inte har ändrat ståndpunkt i Taiwan-frågan.
