Kulstötaren Mireille Nganga och sprintern Emmanuel Grace Mouambako var båda fanbärare under invigningen av spelen i Paris.
De försvann den 5 september tillsammans med en tredje person, tillsammans med sina väskor. Deras pass var dock kvar hos den kongolesiska delegationen.
I inledningen av Paralympics försvann en spelare från Rwandas sittande volleybollag.
Läs mer:
Rwandas coach om försvunna spelaren: ”Bryr mig inte om någon som sjappar från mitt lag”