Fartyget rör sig just nu norrut i Kattegatt och väntas lämna svensk ekonomisk zon omkring klockan 22 på lördagskvällen, uppger Kustbevakningen.
– De lämnade vid 14.30-tiden. Vi har ett flygplan i området och kommer att följa hennes rörelser tills hon lämnar svenska kusten, säger Hanna Bühler, vakthavande befäl på Kustbevakning till DN.
Fartyget lämnade på eget initiativ. Destinationen är satt till Port Said i Egypten, något som SVT var först med att rapportera om.
Yi Peng 3 har legat stilla i Kattegatt mellan Sverige och Danmark i över en månad, efter att två viktiga kommunikationskablar slutat fungera kort efter att Yi Peng 3 passerat över dem.
I torsdags steg svensk polis och och tjänstemän från Statens haverikommisson ombord på fartyget, tillsammans med myndigheter från flera andra länder. Under ombordstigningen genomförde haverikommissionen bland annat tekniska undersökningar av fartyget och intervjuer med besättningsmedlemmarna.
Som en del av överenskommelsen för att svenskarna skulle få gå ombord krävde Kina att inga åtgärder inom brottsutredningen om misstänkt sabotage fick genomgöras. Det gjorde att statsåklagaren Henrik Söderman, som leder utredningen, inte kunde följa med ombord.
Sveriges utrikesminister Maria Malmer Stenergard skriver till TT att regeringen ser allvarligt på att fartyget lämnar nu.
”Det är anmärkningsvärt om fartyget lämnar utan att åklagaren inom ramen för en svensk förundersökning om brott getts möjlighet att inspektera fartyget och höra besättningen”, skriver Malmer Stenergard.
Kabelbrotten i Östersjön ägde rum mellan den 17 och 18 november.
Läs mer:
Uppgifter: Det kinesiska fartyget släpade ankare i 16 mil
Haverikommissionen: ”Fått en bättre bild över situationen”