Det var grannar till Mirandas Rescue Animal Sanctuary som tog sig in på området och upptäckte nedgrävda kroppar.
De har medgett att de gjorde det utan tillåtelse, för att de tyckte att det var konstigt att hundhemmet tagit emot 900 omplaceringshundar, men bara lyckats skaffa nya ägare åt något hundratal.
Över 700 hundar var spårlöst försvunna.
När polisen började undersöka området upptäcktes massgravarna. Hittills har 117 kadaver i olika stadier av förruttnelse grävts upp.
Man har också hittat skallar och skelettdelar från fler hundar.
I marken påträffades även chip från märkta hundar, något som man nu använder för att identifiera och spåra djurens bakgrund.
Ett 70-tal av hundarna konstaterades ha blivit skjutna.
Polisen tror att en lada som finns på området är platsen där hundarna dödades.
Mirandas Rescue har marknadsfört sig som ett ”no kill rescue”, det vill säga att man inte avlivar hundar som lämnas till centret. Det är en icke vinstdrivande välgörenhetsorganisation som drivs med hjälp av donationer.
Polisen utreder nu misstänkt djurplågeri, bedrägeri och stöld, skriver BBC, men ägaren har inte delgivits misstanke om något brott.
Mannen själv har kommenterat medieuppgifterna, och menar att de ger en skev beskrivning av verksamheten och att folk inte ska döma innan de fått hela bilden.
Han fortsätter att hävda att hundhemmet inte avlivar hundar annat än om de lider eller utgör ett allvarligt hot mot andra djur eller människor, och att man ofta får ta emot hundar som andra hundhem inte klarat av.