Beslutet ska ha tagits av World Atheltics beslutande råd, berättade Coe på en presskonferens i Nanjing, Kina, enligt AFP.
Könstestet ska röra sig om så kallad topsning, salivprovtagning för DNA-analys.
Beslutet kommer efter en diskussion om biologiskt kön inom idrotten, och efter en debatt om vem som egentligen har rätt att tävla i damklasserna.
Enligt Sebastian Coe är det ”väldigt viktigt” för att skydda idrottande kvinnor.
– Det är viktigt eftersom det upprätthåller allt som vi har pratat om, särskilt på sistone.
– Vi pratar inte bara om integriteten hos kvinnor i damklasserna, utan garanterar den.
Coe är trygg med att policybeslutet håller lagligt, fortsätter han.
– Vi får acceptera att det är världen vi lever i.
– Jag skulle aldrig ha stakat ut denna väg för att skydda damklasserna om jag inte hade varit beredd att anta den utmaningen.
Enligt Reuters handlar det om ett engångstest. Föreskrifter kring själva proceduren, med testleverantör och tidsplan, kommer att presenteras inom kort.
Testet ska enligt nyhetsbyrån visa att idrottaren inte har den så kallade SRY-genen, som bestämmer manligt kön hos människor och de flesta andra däggdjur.
– Processen är väldigt okomplicerad, faktiskt mycket tydlig, och den är en viktig, säger Coe enligt Reuters.
– Vi kommer envist göra vad som krävs för att skydda damklasserna.
Sebastian Coe ställde så sent som förra veckan upp i ordförandevalet i IOK (Internationella olympiska kommittén) men förlorade där mot Kirsty Coventry, före detta OS-simmare från Zimbabwe.
Om könsfrågan sade Coventry förra veckan enligt Sky:
– Jag vill samla alla internationella förbund och försöka hitta en väg framåt för oss alla.
Sedan tidigare får kvinnor med naturligt för höga testosteronnivåer inte tävla inom friidrotten om de inte på medicinsk väg sänker nivåerna av manligt könshormon. Transidrottare som genomgått manlig pubertet har även de stoppats från att delta i damklasser.
Texten uppdateras.
Läs mer:
Professor: Kromosomerna inte avgörande
Kromosomer och hormoner – idrotten har oroat sig för kön i hundra år
Trump: Förväntar mig att OS förbjuder transkvinnor
Johanna Frändén: Att Trump får spela kvinnosakshjälte visar på idrottsvärldens misslyckande