Departementet skriver på meddelandetjänsten Telegram att raffinaderiet, som ligger i staden Krementjug, förser ukrainska styrkor i Donbass med bränsle.
Attacken, som skedde natten mot söndagen, uppges ha genomförts med långdistansvapen.
Ukrainas utrikesdepartement skriver på plattformen X att natten ”förvandlades till en skräcknatt för Krementjug i Poltavaregionen, sedan Ryssland utfört en storskalig attack med drönare och robotar”.
I samma inlägg uppger utrikesdepartementet att anfallet riktades mot energi- och jordbruksinfrastruktur. Den orsakade skador på fordon och bostadshus, men inga människor kom till skada.
Samtidigt har Ukraina tagit emot ytterligare 1 200 döda från Ryssland, som en del i det utbytesavtal som slöts under samtal i Istanbul nyligen.
”Ytterligare 1 200 kroppar som den ryska sidan hävdar tillhör ukrainska medborgare, inklusive militär personal, har återlämnats till Ukraina”, meddelar det ukrainska samordningshögkvarteret för hantering av krigsfångar.
Undersökningar för att identifiera kropparna kommer att göras inom kort, enligt samordningsorganet.
Länderna har redan tidigare i veckan också meddelat att de utbytt skadade, sjuka och avlidna krigsfångar i flera omgångar.