Anna Magnusson sköt fullt och var i mål 16,1 sekunder efter den segrande fransyskan Lou Jeanmonnot. Norskan Maren Kirkeeide kom tvåa, sekunden före svenskan.
I och med pallplatsen tog Anna Magnusson över som världscupledare från finländskan Suvi Minkkinen och får i jaktstarten på söndag köra i den gula ledarvästen. Fredagens vinnare Jeanmonnot är ny tvåa.
– Det är en dröm som går i uppfyllelse, det hade jag verkligen inte räknat med att få göra. Otroligt häftigt, det ser jag väldigt mycket fram emot, säger Magnusson.
Hon säger att hon inte har någon aning om varför det går så bra nu.
– Det rullar bara på, jag känner mig lugn och har huvudet med mig hela tiden. Det är som att det går av sig självt litegrann.
Hon säger att hon tidigare sett när andra varit i den så kallade zonen.
– Jag har känt att det varit jävligt kul att få känna på det. Nu har jag fått det. Hela hösten har jag känt mig avslappnad och stark.
Magnusson var enda svenska inom topp tio. Hanna Öberg slutade elva, med en bom, Ella Halvarsson kom 22:a med två bom och Elvira Öberg kom på 29:e plats med tre bom.
Linn Gestblom gjorde comeback i ett individuellt skidskytte efter nästan 22 månader. Hon slutade 37:a efter att ha bommat tre skott i ståskyttet.
– Jag klarade inte av att hantera ståskyttet. Hjärtat slog nästan ur bröstkorgen på mig, det slog så hårt. Det blev jättemycket rörelse och det kunde jag inte hantera, säger hon till SVT.
– Den serien vill jag göra om.
Läs mer:
Anna Magnusson bättre än någonsin: ”Hatar ordet veteran”
Ponsiluoma sexa i Österrike: ”Väldigt nöjd”
