Enligt Finlands gränsbevakning ska fartyget Mikhail Kazansky ha korsat landets yttre territorialvattengräns klockan 12.31 på fredagen. Sju minuter senare lämnade det området.
”Gränsbevakningens patrullbåt befann sig vid sidan av det ryska fartyget under hela incidenten och flera försök gjordes att kontakta fartyget via radio”, skriver myndigheten i ett pressmeddelande.
Väderförhållandena i Finska viken ska ha varit goda vid tillfället, med lite vind och bra sikt.
Fartygets kapten misstänks nu för brott, men personen har inte identifierats. Händelsen utreds av gränsbevakningen. Ryssland har inte kommenterat händelsen.
Mikhail Kazansky tillhör Rysslands Östersjöflotta, men är ett obeväpnat forskningsfartyg som hanvänds för undersökningar av havsbotten.
Senast i mitten av juni kränkte fyra ryska flygplan finländskt luftrum vid Lovisa och Borgå.