Bostadshus, lagerlokaler och en sjukvårdsanläggning uppges ha skadats i anfallen.
”De övre våningarna av ett bostadshus med nio våningar har kollapsat och en brand har brutit ut”, skriver Kievs borgmästare på meddelandetjänsten Telegram.
I ett anfall mot ukrainska Brovary har ytterligare en person dödats och en skadats.
Under fredagen planeras en sorgedag för de döda i huvudstaden med flaggning på halv stång och stängda nöjeslokaler, enligt Vitalij Klytjko.
Kiev har utsatts för attacker nästan varje natt den senaste tiden, men Ukraina har också ökat sina attacker mot Ryssland de senaste månaderna. Det sker delvis för att pressa Moskva till förhandling efter nära fyra och ett halvt års ryskt invasionskrig.
Under natten mot torsdagen avfyrades omkring 250 drönare mot den ryska huvudstaden, meddelar dess borgmästare. De flesta sköts ner.
Nattens attacker fick militären i Polen att sätta stridsflyg i beredskap. Liknande åtgärder vidtogs i Rumänien och där kraschade en drönare i ett obebott område.