Två 18-åriga pojkar häktades i söndags misstänkta för grovt sexuellt övergrepp och grovt olaga tvång.
Händelserna ska ha skett i början av oktober på Sigtuna humanistiska läroverks internat.
En tredje pojke, som släpptes vid den första häktningsförhandlingen, häktades även han på måndagen misstänkt för misshandel och olaga tvång, enligt TV4. Han är 17 år.
Det var i torsdags som polisen grep pojkarna och föräldrar fick information om att en allvarlig händelse hade inträffat.
Enligt uppgifter till flera medier ska det ha skett vid en nollningsritual som spårat ur.
Men det är något åklagaren Lisa dos Santos förnekar.
– Det är inget jag känner till eller som har framkommit i utredningen, säger hon till DN.
Nollning är en sorts ritual som genomförs när ettor börjar gymnasiet och ska ”invigas”. Men utredningen visar något annat, menar hon.
– Min bild är att det verkar vara gärningar inom det så kallade ”systemet”. Något som inte bara händer i början av terminen utan som löper över en längre tid, säger hon till DN.
Flera målsägande ingår i utredningen, alla pojkar enligt åklagaren. De tre misstänkta bodde på internatet vid tillslaget men ska nu vara avstängda av skolan.
De två häktade 18-åringarna ska enligt åklagaren ha agerat vid en och samma händelse.
Advokaten Hanna Lindblom, som företräder en av de häktade pojkarna, har sagt till Aftonbladet att han är ett offer för en toxisk kultur som sitter i väggarna på internatet.
– Han medger att det är saker som äger rum inom ramen för en sedvänja på skolan, säger hon.
Advokaten Elisabeth Massi Fritz, som företräder en målsägande, säger till DN att det är ett sätt att blanda bort korten.
– Det är fel att framställa de misstänkta som offer när det är målsäganden som har utsatts för allvarliga brott. Det är viktigt att inte blanda ihop förövare med brottsoffer, säger hon.
Det är ett sätt att förminska brottsoffrets utsatthet och flytta fokus från gärningarna, menar hon.
– Det finns ingen kultur eller sedvänja som kan rättfärdiga våld, säger Massi Fritz.
Även åklagaren Lisa dos Santos vänder sig emot det perspektivet.
Äldre elever kan inte gömma sig bakom att de råkat ut för liknande saker när de var yngre, menar hon.
– Det är ju individer, inte kulturen i sig, som upprätthåller en sådan här struktur. Rent juridiskt är de misstänkta för brott som de har utsatt andra för, brottsoffren.
Det utredningen hittills har visat är att det verkar finnas ett maktsystem på skolan där vissa äldre individer har positioner som ger dem befogenhet att utöva makt, kontrollera och bestraffa yngre elever som befinner sig lägre ner i hierarkin.
Styrelsen för internatskolan gjorde på tisdagen ett uttalande om att den ”ser mycket allvarligt på det som hänt”.
”Vi känner med de som blivit utsatta och med alla elever och föräldrar som påverkas negativt och blir oroliga”, skriver Sigtunaskolans ordförande Paula Guillet de Monthoux och tillägger:
Styrelsen är ”högst medveten om de risker som en internatmiljö medför” och arbetar aktivt och systematiskt mot kränkande beteende. ”Nu behövs det tid för att gå till botten med det som hänt och se vilka ytterligare åtgärder som kan behövas”.
Skolchefen Sofia Kinberg vill i nuläget inte svara på frågor, skriver hon i ett mejl till DN.
– Det pågår fortfarande en aktiv utredning och med hänsyn till den vill jag inte kommentera enskilda händelser. Vi behöver tid för att få överblick, och vi behöver tid för att ägna oss åt eleverna här på plats, skriver hon.