Mari Nyhagen öppnade målskyttet i minut 41, innan Elin Sørum fyra minuter senare kunde utöka till 2–0 på straff.
I inledningen av andra halvlek gjorde Mathilde Janzen 3–0, innan ett självmål av Apolonia skrev Hammarbys segersiffror till 4–0.
I kvalfinalen den 8 augusti möter Hammarby vinnaren mellan Juventus och Torreense. Vid seger där väntar playoff till Champions League.
Läs mer om fotboll.